Σε αυστηρά επιλεγμένα περιστατικά εφαρμόζεται η μέθοδος της διέγερσης του Κινητκού Φλοιού των εγκεφαλικών ημισφαιρίων (Motor Cortex Stimulation). Πρόκειται για περιστατικά όπου άλλες μέθοδοι νευροτροποποίησης έχουν αποτύχει ή δεν δύνανται να εφαρμοσθούν, όπως στον κεντρικό νευροπαθητικό πόνο μετά από εγκεφαλικό επεισόδιο.
Ο ασθενής, αφού υποβληθεί σε εξειδικευμένο έλεγχο για τον προσδιορισμό του κινητικού φλοιού, οδηγείται στη χειρουργική κλίνη, όπου με τη χρήση πλοηγού διενεργείται μίνι κρανιοτομία και τοποθέτηση επισκληρίδιου ηλεκτροδίου στην περιοχή του κινητικού φλοιού. Το ηλεκτρόδιο μετά συνδέεται με νευροδιεγέρτη στην υποκλείδια χώρα. Ο ασθενής εξέρχεται μετά από μερικές ημέρες, αφού έχουν γίνει οι αρχικές ρυθμίσεις.